اجتمعت الهيئة المديرة للمركز التونسي لدراسات الأمن الشامل يوم 12جوان 2018 للتداول في موضوع سد الشغور الحاصل في منصب رئاسة المركز إثر تعيين العميد مختار بن نصر على رأس اللجنة الوطنية لمكافحة الارهاب، وبعد المداولات والتشاور تم انتخاب رفيق الشلي، كاتب الدولة السابق المكلف بالأمن العام و المدير العام الأسبق للحرس الرئاسي، رئيسا جديدا للمركز التونسي لدراسات الأمن الشامل ابتداء من تاريخه.
